1、契稅：
(1)買方首次購房90平方以下的房產按照1%繳納;
(2)買方首次購房90平方以上(含90平)144平方以下的房產按照1.5%繳納;
(3)以下情況按照3%繳納：144(含144平)平方以上;買方不是首次購房;車庫;非普通住宅(商業用房)。
2、營業稅：房產證滿2年，144平方以下的普通住宅房產免征營業稅;房產證不滿2年，按照5.55%繳納營業稅;房屋面積超過144平方，房產證滿2年的按照差額繳納，計算公式為：(上次購買價格—現在出售價格)*稅率5.55%;商鋪差額繳納，計算公式為：(上次購買價格—現在出售價格)*稅率5.55%。
3、個人所得稅：(一般由賣方繳納)
(1)房產證滿五年，并且是賣方夫妻名下唯一一套房產免征個人所得稅。
(2)賣方夫妻名下不是唯一房產或房產證未滿5年，按照1%繳納。
(3)商鋪按照差額繳納，計算公式為：(上次購買價格—現在出售價格)*稅率20%。
1、土地性質不同，這也是本質區別。
這種公寓類型的建筑一般都配建在商住性質的用地之上。每塊土地的性質用途，在國土出讓合同上都會有明確約定和限制。一般而言，普通住宅土地性質為住宅用地或商住用地中的住宅部分，而商業公寓則是商業或綜合用地。土地性質的不同也就決定了下面幾項的差別.
2、產權年限較短。
普通住宅一般在70年，而商住公寓等一般為40年或者50年。當然，其期限屆滿后需要付費續期應當是沒有任何爭議的，只看落地細則。
3、落戶政策差異。
各個城市規定有不同，往往只有住宅類產品才能落戶，因此通常只有普通住宅和基于住宅用地上的公寓(例如人才公寓，住宅型公寓等)才能落戶，前不久長沙有個公寓落戶政策除外，而商住和綜合用地的商業公寓由于不屬住宅性質，就不能落戶。
因為如此，就缺少了教育方面優勢，那么在保值增值能力這項功能上自然也就比較吃虧。
4、生活成本不同。
商住公寓的水、電、物業、電梯費等參照商業標準繳納，比普通住宅的居民水電貴1.5-2倍左右。另外有很多是不準通天然氣的。所以吃飯只能通過電器來解決，細賬就不算了，經年累月，這都是一筆筆不小的開支。
5、稅費標準較高。
由于酒店式公寓與普通住宅土地性質及物業類型的差異，導致二者在稅費繳納標準上也有較大的不同。享受不到普通住宅稅費優惠或減免, 契稅按照3%繳納。
轉讓出售時，未滿2年，需按全額的5%繳納增值稅;按差額的20%繳納個人所得稅;滿2年的增值稅按差額的5%計征，個人所得稅相同。評估需現場勘查，基本與實際成交價形同，甚至高于實際成交價也是常有的事情。
6、公攤面積差異。
酒店式公寓等一般都是通廊式的布局，入口大廳及電梯廳都會更做得“大氣”，加上長長的走廊，設備間也要比普通住宅多，因此公攤面積一般會達到40%左右，有的會更高!
