農村宅基地確權證應當到當地鄉鎮的土地管理部門辦理或者縣級以上人民政府國土資源行政主管部門，并需要提交相關材料以及證明文件，按照規定的程序和方法來進行辦理，具體情況可以咨詢當地的土地管理部門，并按照相關規定的程序和要求來進行處理。
1、申報：
凡是擁有宅基地的土地使用權人，須領取由土地部門統一印發的《農村宅基地使用權申報登記表》，以戶為單元，每宗宅基地填寫一份。村民使用的宅基地，必須提交由經濟社、村委會二級經濟組織及鎮政府出具的土地權屬來源證明。然后由調查組負責收集申報材料上交土地管理部門對權屬進行審核。
2、權屬調查：
國土部門根據土地使用權人的申請，對宅基地范圍、界線、界址、權屬性質、用途等情況進行實地調查、記錄并經相鄰各方認定，填寫宅基地地籍調查表，繪制宗地草圖，為地籍測量作準備。在宅基地調查過程中，本宗地使用者和相鄰地使用者應按通知規定時間內到場共同指界，對雙方共同確認的用地界線和界址點進行簽名、蓋章，如不能參加指界的，應書面委托代理人出面指界。
3、審核與公告：
經土地行政主管部門審核，對認為符合登記要求的宗地進行公告，公告內容主要包括土地使用者的名稱、地址、準予登記的土地權屬性質、面積、坐落、四至范圍等。
4、審批：
公告期滿，土地權利者及其他土地權益有關者對土地登記審核結果未提出異議的，在農村宅基地使用權登記審批表上簽署同意登記發證的意見，由市(縣)人民政府領導簽章，并加蓋市(縣)人民政府土地登記專用章。
5、登記注冊：
根據農村宅基地登記審批表結果，以宗地(宅基地)為單位逐項填寫土地(宅基地)登記卡、土地(宅基地)歸戶卡及土地證書，并由登記人員和土地行政主管部門主管領導分別在兩卡上簽字。
6、頒發土地證：
最后頒發土地證。
